Des données récentes renforcent l'utilité clinique du test de diagnostic du cancer de la prostate Exosome
NEW YORK – Les données publiées le mois dernier dans Prostate Cancer and Prostatic Diseases renforcent le dossier d’utilité clinique du test de prostate ExoDx de la filiale de Bio-Techne, Exosome Diagnostics, a annoncé la société.
L’étude a été menée à la suite d’un essai d’utilité clinique mené par la société dont les résultats ont été publiés en 2020, également dans Cancer de la prostate et maladies de la prostate. Dans l’étude originale, menée par Exosome Diagnostics et CareFirst BlueCross / BlueShield du Maryland, les données ont été recueillies auprès de 1 049 hommes âgés de 50 ans ou plus qui présentaient des taux légèrement élevés d’antigènes spécifiques de la prostate. Bien que tous les patients de l’étude aient reçu le test ExoDx Prostate , les patients du groupe témoin en aveugle n’ont pas obtenu leurs résultats et ont procédé au traitement standard.
Le test moléculaire mesure une signature d’expression de trois gènes dans l’urine et utilise un algorithme pour fournir un score de risque discriminant entre le cancer de la prostate bénin ou de bas grade et le cancer de la prostate de haut grade.
Cette étude originale a révélé que le groupe recevant les résultats des tests avait subi 23% plus de biopsies que le groupe témoin, mais que les biopsies étaient appliquées de manière plus appropriée et qu’environ 30% plus de cancers de la prostate de haut grade ont été trouvés.
Dans la nouvelle étude, une analyse rétrospective des résultats a été menée deux ans et demi après l’étude initiale sur 833 patients pour voir comment le test affectait leurs soins et leurs résultats, a déclaré Johan Skog, CSO de la société et auteur principal des deux articles. Les chercheurs ont évalué les résultats de la pathologie clinique dans les deux cohortes de l’étude et ont comparé les reports de biopsie et le délai de biopsie entre les bras de l’étude pour les cas présentant des scores de risque faible ou élevé.
Les auteurs ont constaté que les patients identifiés comme à faible risque par le test ExoDx recevaient moins de biopsies, reportaient le délai de leur première biopsie et étaient significativement moins susceptibles d’être diagnostiqués plus tard avec un cancer de la prostate de haut grade. Le délai moyen entre le test et la première biopsie était significativement plus long dans la cohorte à faible risque qui a reçu ses résultats par rapport aux patients à haut risque du même groupe et aux patients à faible risque du groupe en aveugle. Les patients à faible risque du deuxième groupe n’ont pas pu être identifiés par des méthodes de soins standard et ont subi une biopsie malgré leur risque plus faible.
En outre, les patients à faible risque qui connaissaient les résultats de leurs tests étaient moins susceptibles d’avoir des biopsies que les patients à haut risque du même groupe, alors que le choix d’avoir une biopsie ne différait pas entre les patients à haut risque et à faible risque dans le groupe témoin, les chercheurs ont noté dans l’article. Skog a déclaré que cela montrait qu '«il n’y a aucun moyen pour le médecin d’identifier les patients à faible et à haut risque avec d’autres moyens », ajoutant que le test « fournit des informations vraiment uniques que le médecin n’est pas en mesure de déduire d’autres facteurs de type de soins ».
Selon Skog, ces nouvelles données renforcent encore l’utilité du test et montrent que les médecins qui ne fournissent pas le test n’auront pas les résultats favorables observés dans cette étude. Les médecins « veulent toujours voir que les soins pour leur patient sont améliorés par l’utilisation du test, et c’est ce que cette étude montre », a-t-il déclaré.
Ces résultats sont une mesure provisoire d’une période de suivi de cinq ans, et d’autres résultats seront analysés et publiés dans deux ans et demi, a-t-il noté.
La société mène également d’autres études sur le test, examine d’autres utilisations indiquées et évalue comment il pourrait être intégré à l’imagerie par résonance magnétique ou à d’autres biomarqueurs, a déclaré Kogg. Bien que cette étude se soit concentrée sur la population de dépistage initial des patients présentant un taux d’APS légèrement élevé, l’entreprise mène également des études dans la population de surveillance active.
Plateforme multiomique
Au-delà du test du cancer de la prostate, Exosome Diagnostics a construit et utilise une plate-forme multiomique pour intégrer davantage ses biomarqueurs de biopsie liquide, a déclaré Skog.
Il isole conjointement l’ADN acellulaire et l’ARN exosomal sur une plate-forme de séquençage de nouvelle génération pour « construire un bien meilleur piège à souris » et avoir accès à plus d’informations moléculaires, développant ainsi de meilleurs tests, a-t-il déclaré, bien qu’il ait refusé de nommer l’instrument NGS sur lequel Exosome Dx développe sa propre technologie. Avec la plate-forme encore sans nom, la société peut effectuer des analyses de méthylation et de mutation sur cfDNA, ainsi que la détection de mutations via l’analyse d’expression différentielle du transcriptome de l’ARN avec séquençage sur l’ARN exosomal. Il fournit « un aperçu très unique des différents types de maladies », a-t-il déclaré, et la plate-forme peut être appliquée « de manière agnostique de la maladie ».
Le kit ExoLution Plus de la société est sa méthode initiale d’isolation d’échantillons et a déjà été utilisé pour améliorer la détection des mutations, a déclaré Kogg, notant que le kit permet l’ensemble de la plate-forme multiomique.
Dans un article publié dans Annals of Oncology en 2017, la société et ses collaborateurs de recherche ont découvert que l’isolement de l’ARN exosomal et de l’ADNcf pourrait améliorer la détection de la mutation EGFR chez les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules. L’utilisation de l’ADNcf et de l’ARN exosomal a entraîné une sensibilité de 98% pour détecter les mutations activatrices de l’EGFR et de 90% pour les mutations EGFR T790M, tandis que l’utilisation de l’ADN tumoral circulant avait à elle seule une sensibilité de 82% pour activer les mutations et de 84% pour T790M.
Actuellement, la plate-forme est utilisée pour le développement de diagnostics internes et est proposée aux partenaires pharmaceutiques, bien qu’il n’y ait pas encore de données publiées à ce sujet, a déclaré Skog. La plate-forme fournit un « guichet unique » pour tirer le meilleur parti d’un échantillon, en extrayant à la fois l’ADNcf et l’ARN exosomal en une seule étape et en permettant à l’entreprise « d’obtenir de meilleures réponses de nos biomarqueurs ».
À l’heure actuelle, la société a des programmes de diagnostic axés sur le cancer colorectal et d’autres indications en oncologie, et elle voit des avantages à utiliser la plate-forme pour examiner à la fois l’ADNcf et l’ARN exosomal, plutôt que les méthodes traditionnelles de biopsie liquide consistant simplement à regarder l’ADNcf, a déclaré Skog. La plateforme est capable de préserver l’intégrité de ce qu’elle capture, permettant une analyse de petits ARN ainsi qu’un profilage global des ARN messagers et des ARN longs non codants. La plate-forme a également facilité l’analyse de la cartographie des voies pour comprendre quelles voies associées à la maladie sont dérégulées dans différentes conditions, a-t-il ajouté.
D’autres sociétés de diagnostic utilisent également la biopsie liquide pour analyser à la fois l’ADNcf et l’ARN. La société de diagnostic du cancer Circulogene propose des tests qui utilisent le séquençage de nouvelle génération et la PCR pour analyser l’ADN et l’ARN, tandis que Caris Life Sciences a développé une version à base de sang de son service complet de profilage génomique qui séquence cfDNA et cfRNA.
Bio-Techne a également des programmes en dehors de l’oncologie où la plate-forme est utilisée, tels que les maladies neurodégénératives, la surveillance des greffes, les maladies inflammatoires et les maladies auto-immunes. Alors que la technologie d’Exosome Dx peut extraire à la fois l’ADNcf et l’ARN exosomal, Skog a noté que la société n’extrait l’ADNcf « que lorsqu’elle ajoute de la valeur », comme dans certaines applications en oncologie où la détection précoce des marqueurs de méthylation est utile. De nombreuses applications, y compris le test ExoDx Prostate et le test de rejet de greffe de rein ExoTru, n’incluent pas la capture de cfDNA.
La capacité d’extraire du « matériel de haute qualité » a permis à l’entreprise d’effectuer des analyses uniques et d’utiliser des types d’échantillons moins courants, comme le liquide céphalorachidien et la salive. La salive a souvent été difficile à travailler en raison de la contamination microbienne, mais la société a pu utiliser sa plate-forme multiomique pour effectuer un profilage complet du transcriptome de l’ARN dans un échantillon de salive, a-t-il déclaré.
Par exemple, l’entreprise utilise sa technologie pour cartographier et surveiller les voies auto-immunes qui sont exprimées de manière différentielle et dérégulées dans la salive des patients atteints de la maladie de Sjögren, une maladie auto-immune qui affecte les glandes sécrétrices de liquide. La société a une étude en cours pour profiler l’ARN dans des échantillons de salive de patients atteints de la maladie de Sjogren, a-t-il noté.
La plate-forme fournit un « beaucoup plus large ... pour examiner plusieurs types de maladies » et aide à « résoudre des questions complexes sur les biomarqueurs », a-t-il déclaré.
Plateforme multiomique